In Italia lo abbiamo visto con la maglia dell'Hellas Verona ma, ovviamente, gli anni d'oro Rafa Marquez gli ha spesi a Barcellona dal 2003 al 2010, dove tra le altre cose ha vinto anche quattro campionati spagnoli e due Champions League. Adesso 'El Gran Capitán' è pronto al ritiro dal calcio giocato.
Anche se manca ancora il suo annuncio ufficiale, la decisione sembra ormai presa: con le partite contro il Chivas ed il Pachuca, si chiuderà la stagione e di conseguenza anche la carriera di Rafa Marquez.
Il suo Atlas purtroppo non naviga in buone acque, anzi, occupa la penultima posizione della Liga MX. Un finale di carriera opposto rispetto a quanto fatto invece in quasi tutto il resto degli anni.
Rafa Marquez è considerato il più forte difensore messicano di tutti i tempi e sicuramente uno dei giocatori più rappresentativi in generale del 'Tricolor'.