Mourinho a également laissé sa marque à Chelsea, remportant deux titres de Premier League en trois ans, mais il a été licencié après une baisse de niveau au début de la saison 2007-2008. L'année suivante, il se lance dans un nouveau défi en Italie, en remplaçant Roberto Mancini à l'Inter.
Les Nerazzurri remportent leur quatrième titre consécutif en Serie A lors de la première saison de Mourinho, mais il n'est pas là pour poursuivre leur domination nationale. Le propriétaire de l'Inter, Massimo Moratti, voulait la Ligue des champions. Manchester United, tenant du titre, a éliminé l'Inter en huitièmes de finale avant d'atteindre une autre finale lors de l'édition 2008-09 de la compétition. Mais Mourinho allait revenir en force.
L'Inter perdait de grandes stars comme Adriano, Hernan Crespo et Luis Figo, mais Mourinho ajoutait Diego Milito, Thiago Motta et Wesley Sneijder à ses rangs avant sa deuxième année à la tête de l'équipe. Les Nerazzurri ont mal commencé la phase de groupes de la Ligue des champions, ne remportant qu'un seul de leurs cinq premiers matches, avec une défaite 2-0 à Barcelone lors de la cinquième journée. Cependant, les Nerazzurri ont relevé la tête en battant le Rubin Kazan à domicile et en se préparant à affronter Chelsea, l'ancien club de Mourinho, en huitième de finale.
L'Inter a battu les Blues à San Siro et à Stamford Bridge pour atteindre les quarts de finale, et a battu le CSKA Moscou pour obtenir une demi-finale à suspense contre le Barca. Les géants espagnols visaient un deuxième titre consécutif en Ligue des champions sous la direction de Pep Guardiola, et peu de gens s'attendaient à ce que l'Inter leur pose beaucoup de problèmes après leurs rencontres en phase de groupe.
Mais Mourinho croit en son équipe. Pedro a donné l'avantage au Barça dès le match aller à San Siro, mais l'Inter a réalisé une superbe performance pour revenir et s'imposer 3-1, avec Sneijder, Maicon et Milito sur la feuille de match.
L'Inter a fait preuve d'une résistance encore plus grande lors du match retour au Camp Nou, puisqu'il a été contraint de jouer pendant plus d'une heure à dix après que Motta a reçu un carton rouge pour avoir donné un coup de main à Sergio Busquets. Les visiteurs se sont sentis à juste titre lésés par la décision, les images montrant qu'il n'y avait eu qu'un contact minime, mais cela n'a fait que renforcer leur détermination.
Gerard Piqué a ouvert la voie à une finale passionnante, mais les hommes de Mourinho ont tenu bon pour remporter une étonnante victoire 3-2 sur l'ensemble des deux matches. Après avoir tenu Lionel Messi et ses coéquipiers tranquilles, ils avaient l'impression que leur nom figurait déjà sur le trophée.
L'Inter a tenu bon pour battre le Bayern Munich 2-0 en finale au Bernabeu, grâce à deux buts brillants de Milito. Les Nerazzurri sont ainsi devenus la première équipe italienne de l'histoire à remporter le triplé, tandis que Mourinho les a également guidés vers un nouveau titre de Serie A et une victoire dans la Coppa Italia.
Aucune campagne n'est plus représentative de la personnalité de Mourinho que celle de 2009-10. C'était l'apogée pour lui et pour l'Inter, qui espère canaliser le même esprit lorsqu'il retournera en finale de la Ligue des champions contre City le 10 juin.