Desde então, João Paulo II passou a ser visto como uma espécie de “protetor espiritual” do clube. Em 2010, o Papa foi oficialmente declarado padroeiro do Fluminense, ganhando ainda mais espaço na cultura da torcida. Em 2005, no dia seguinte à morte do pontífice, a torcida homenageou João de Deus durante um Fla-Flu decisivo pela Taça Rio. O Tricolor venceu por 4 a 1, conquistou o segundo turno do Estadual e, posteriormente, o título carioca diante do Volta Redonda.