A Conmebol, da América do Sul, teve direito a seis vagas neste formato do Mundial de Clubes. Quatro delas foram destinadas aos campeões da Libertadores entre 2021 e 2024 (Palmeiras, Flamengo, Fluminense e Botafogo, respectivamente), enquanto as duas restantes ficaram com os clubes mais bem colocados no ranking da entidade — desde que o país não tenha mais de dois representantes, a menos que esses sejam campeões continentais, como aconteceu com o Brasil.
Sem conquistar a Libertadores nesse período e distante do topo do ranking da Conmebol, o São Paulo não conseguiu garantir a classificação. O clube até disputou a edição de 2024 do torneio continental, mas foi eliminado nas quartas de final pelo Botafogo e não somou pontos suficientes para brigar por uma das vagas por ranking, que acabaram com River Plate e Boca Juniors.