A derrota na final do Paulistão para o Palmeiras deixou marcas de indignação no Peixe, especialmente por conta de dois lances capitais que geraram grande controvérsia e alimentaram a frustração da equipe e da torcida.
O primeiro ponto de discordia foi o pênalti marcado em favor do Palmeira, que originou o primeiro gol do alviverde. Em um primeiro momento, o árbitro não marcou a pênalidade após Endrick cair na área em contato com o goleiro João Paulo. No entando a decisão foi revertida após consulta ao VAR, comandado por Rodrigo Guarizo Ferreira do Amaral. Este interpretou que houve falta na jogada e recomentou a revisão do lance - o que gerou forte contestação por parte dos jogadores santistas.
Para aumentar a confusão, um suposto movimento irregular da bola no momento do tiro de meta do Palmeiras, que originou o lance, também foi analisado pela equipe de arbitragem. No entanto, ficou concluído que não houve infração e o pênalti foi mantido.