A terceira fase da Copa do Brasil conta com a entrada dos clubes mais bem classificados no Brasileirão do ano passado, além dos times que avançaram da fase anterior. Nessa etapa, foi realizado um novo sorteio para definir os confrontos e os jogos serão disputados em ida e volta.
Terceira fase (times da direita decidem em casa):
Operário-PR 2 (6) x (7) 2 Vasco da Gama, no agregado - Vasco classificado
Fluminense 5 x 1 Aparecidense, no agregado - Fluminense classificado
Paysandu 0 x 5 Bahia, no agregado - Bahia classificado
Botafogo 4 x 1 Capital-DF, no agregado - Botafogo classificado
Internacional 4 x 0 Maracanã-CE, no agregado - Internacional classificado
Retrô 2 (4) x (1) 2 Fortaleza, no agregado - Retrô classificado
Ceará 0 x 4 Palmeiras, no agregado - Palmeiras classificado
Maringá 2 x 6 Atlético-MG, no agregado - Atlético-MG classificado
São Paulo 4 x 2 Náutico, no agregado - São Paulo classificado
Novorizontino 0 x 2 Corinthians, no agregado - Corinthians classificado
CSA 3 x 2 Grêmio, no agregado - CSA classificado
Brusque 0 x 1 Athletico-PR, no agregado - Athletico-PR classificado
Santos 1 (4) x (5) 1 CRB, no agregado - CRB classificado
Botafogo-PB 2 x 5 Flamengo, no agregado - Flamengo classificado
Criciúma 1 x 6 RB Bragantino, no agregado - RB Bragantino classificado
Cruzeiro 5 x 0 Vila Nova, no agregado - Cruzeiro classificado