Setelah periode singkatnya di Lyon di Ligue 1 dan Chicago Fire di MLS, Shaqiri kembali ke klub masa kecilnya Basel pada 2024. Dia terikat dengan klub tersebut hingga 2027, dan meskipun ia akan berusia 34 tahun pada bulan Oktober, dia belum berencana untuk memperlambat langkahnya.
"Di Basel, kami menunjukkan musim lalu betapa ambisius dan lapar kami untuk meraih gelar. Saya merasakan hal yang sama secara pribadi: Saya tidak kembali ke sini untuk mengakhiri karir saya, tetapi untuk menjadi sesukses mungkin dengan klub kota kelahiran saya dan untuk memenangkan setiap gelar yang kami punya kesempatan," katanya dalam wawancara yang sama. "Dan, tentu saja, tujuan besar adalah akhirnya bermain di Liga Champions lagi dengan Basel. Saya fokus pada itu sekarang – dan itulah mengapa pensiun belum menjadi isu."