Sim. O time conquistou o título da Copa São Paulo de Futebol Júnior em 2007 e 2026, ambas as vezes em cima do São Paulo. em 2007, o jogo terminou empatado em 1 a 1 no tempo normal, levando a decisão para os pênaltis, onde a Raposa levou a melhor e venceu por 6 a 5, conquistando seu primeiro e único título na competição.
Já em 2026, a equipe conquistou o bicampeonato com 100% de aproveitamento e na final, bateu o tricolor paulista por 2 a 1, na Arena Mercado Livre Pacaembu.
Apesar de ter alcançado a glória em 2007 e 2026, o Cruzeiro também amargou outras três decisões em sua história. Em 1996, a equipe chegou à final, mas foi derrotada pelo América-MG, que, naquele ano, levantou sua primeira taça da Copinha ao vencer por 2 a 1. Seis anos depois, em 2002, o Cruzeiro foi derrotado pela Portuguesa-SP, que conquistou seu segundo título da competição com um 1 a 0 no Canindé. E em 2024, a raposa foi derrotada pelo Corinthians, maior campeão do torneio, por 1 a 0, na Neo Química Arena.
Na próxima edição, em 2027, a equipe buscará seu tricampeonato.