การแข่งขันแอฟริกา คัพ ออฟ เนชันส์ เจอโควิด-19 เล่นงานตั้งแต่ช่วงเริ่มทัวร์นาเมนต์ โดยเริ่มมีนักเตะหลายทีม ติดเชื้อโควิด-19
สหพันธ์ฟุตบอลเซเนกัลได้ยืนยันว่านักเตะตัวหลักอย่าง เอดูอาร์ เมนดี้ นายประตูทีม เชลซี, คาลิดู คูลิบาลี กองหลังจาก นาโปลี และ ฟามาร่า ดิดิอู กองหน้า อลันยาสปอร์ เป็นสามนักเตะสำคัญที่มีผลตรวจเชื้อโควิด-19 ออกมาเป็นบวก และจะหมดสิทธิ์ลงสนามในเกมวันจันทร์นี้กับ ซิมบับเว้ ถ้าหากผลตรวจไม่ผิดพลาด ซึ่งทางฝั่ง เซเนกัล มีนักเตะติดเชื้อไปแล้วก่อนหน้านี้ 3 ราย และทีมสตาฟฟ์อีก 6 ราย
ซึ่งผลที่ออกมาเป็นบวกของ เมนดี้ สร้างงความกังวลใจว่า ซาดิโอ มาเน จะพลอยติดเชื้อไปด้วยหลังจากทั้งคู่เดินทางมาจากอังกฤษด้วยเครื่องบินลำเดียวกัน
ทางฝั่ง แคเมอรูน เจ้าภาพ จะไม่มีนักเตะถึง 5 คนในเกมนัดเปิดสนาม ด้วยผลจากไวรัสโควิด-19 ด้วยเช่นกัน ขณะที่ กาบอง ก็พบนักเตะติดเชื้อหลายรายรวมทั้ง ปิแอร์-เอเมอริค โอบาเมยอง กองหน้ากัปตันทีม ขณะที่ กีนี, เคปเวิร์ด, แกมเบีย และ ตูนิเซีย ก็พบผู้ติดเชื้อด้วยเช่นกัน
ทั้งนี้ได้มีมาตรการใหม่มาจาก สมาพันธ์ฟุตบอลแอฟริกา (CAF) ได้ระบุว่าการแข่งขันแอฟริกา คัพ ออฟ เนชันส์ จะดำเนินต่อไป แม้ว่า 11 ตัวจริงที่ส่งลงไปจะไม่มีผู้รักษาประตูก็ตาม
โดยหากทีมไหนไม่สามารถส่งนักเตะทำการแข่งขันได้ครบจะถูกปรับแพ้ในเกมนัด 2-0 ทันที