Mientras que la Euro 2016 puede considerarse como un desastre personal para el delantero de 27 años, que no anotó un solo gol en seis partidos, su campaña en el Bayern fue todo lo contrario.
Müller realizó una de las temporadas más prolíficas de su carrera hasta la fecha marcando 32 goles en todas las competiciones y ayudando a que los bávaros alcanzasen el doblete.