Nació el 4 de abril del 2000 en Teodelina, provincia de Santa Fe, y a los 12 se mudó a Buenos Aires. Tuvo la posibilidad de irse a Rosario, pero eligió La Boca. Y aunque se transformó en uno de los proyectos más importantes de las inferiores de Boca, finalmente Manuel Roffo, a días de cumplir los 21 años, terminó rescindiendo su contrato y yéndose del club sin haber debutado en Primera División.
Llegó bajo la gestión de Jorge "Coqui" Raffo, excoordinador de las divisiones juveniles, quien enseguida notó su potencial. Desde su primer momento en el club fue capitán: llevó la cinta en Novena, Octava y Séptima, siendo el líder de una categoría multicampeona y en donde se destacaban, también, otros nombres importantes como Facundo Colidio, vendido en una cifra millonaria a Inter, y Marcelo Weigandt y Agustín Obando, futbolistas que debutaron en Primera de la mano de Gustavo Alfaro
Fue en 2015 cuando en el Xeneize decidieron darle un trato preferencial: con edad de Séptima División, pasó a jugar en la Quinta y comenzó a entrenarse con la Reserva de Rolando Schiavi. Además, fue cuando comenzó su etapa en la Selección argentina, siendo el arquero de la Sub 15 en el Mundial de Colombia. En el combinado nacional fue tenido en cuenta desde entonces para todo: fue sparring en Rusia 2018 y el titular en la Copa del Mundo Sub 20 de Polonia 2019.
En 2016, con 16 años, firmó su primer contrato que lo vinculaba con la institución hasta 2019, el cual fue renovado hasta junio de 2021. En 2017 fue cuando dio el gran salto: luego de su participación en el Sudamericano Sub 17 en Chile, Guillermo Barros Schelotto lo llevó a Ciudad del Este para que realice su primera pretemporada con el plantel de Primera.
Entre 2018 y 2020 terminó de asentarse: a pesar de la presencia de Javier Bustillos (hoy en All Boys), quien es tres años más grande que él, Manu pudo ganarse el lugar y alternar como titular en Reserva, al mismo tiempo que continuó entrenándose con los profesionales convirtiéndose en el tercer arquero. Tanto así que tanto Alfaro como Miguel Ángel Russo lo pusieron en la lista de buena fe para las últimas dos ediciones de la Copa Libertadores.
"Siempre quise quedarme, es mi segunda casa. Acá me dieron todo y lo más lindo sería debutar con estos colores", dijo alguna vez.. Sin embargo, nunca le llegó esa oportunidad, teniendo siempre por delante a Esteban Andrada, Agustín Rossi y Javier García. Ante ese panorama, optó por rescindir antes de tiempo su vínculo que finalizaba en junio para continuar su carrera en Tigre, en la Primera Nacional.